Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rdm1Q9CQK3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms