Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQ90 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQ90 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQ90 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQ90 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQ90 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQ90 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQ90 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQ90 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQ90 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQ90 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQ90 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQ90 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQ90 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQ90 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQ90 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQ90 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQ90 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQ90 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms