Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms