Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms