Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gtf2a1Q99PM3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms