Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms