Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms