Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup155Q99P88 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup155Q99P88 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms