Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vgll1Q99NC0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms