Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms