Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln4Q99NB8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln4Q99NB8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubqln4Q99NB8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubqln4Q99NB8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ubqln4Q99NB8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ubqln4Q99NB8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ubqln4Q99NB8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ubqln4Q99NB8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ubqln4Q99NB8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ubqln4Q99NB8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubqln4Q99NB8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ubqln4Q99NB8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ubqln4Q99NB8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ubqln4Q99NB8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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