Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl43Q99N89 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms