Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a8Q99N10 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a8Q99N10 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms