Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rnf17Q99MV7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms