Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprtQ99M80 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.1 ms