Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnps1Q99M28 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnps1Q99M28 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms