Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms