Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chst12Q99LL3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Chst12Q99LL3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms