Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms