Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp16Q99LG0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms