Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1aQ99L02 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms