Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms