Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms