Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emc3Q99KI3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms