Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn1Q99K10 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms