Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms