Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ctu1Q99J10 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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