Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CsprsQ99388 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms