Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms