Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc8b1Q925Q3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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