Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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