Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms