Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms