Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms