Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Afg3l1Q920A7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms