Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms