Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms