Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx15Q91WE1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms