Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdc42ep1Q91W92 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdc42ep1Q91W92 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms