Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms