Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms