Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc3Q91W40 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms