Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn8Q91VA3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn8Q91VA3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms