Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RestQ8VIG1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RestQ8VIG1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RestQ8VIG1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RestQ8VIG1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RestQ8VIG1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RestQ8VIG1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RestQ8VIG1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms