Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crb1Q8VHS2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crb1Q8VHS2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms