Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms