Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam20bQ8VCS3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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