Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms