Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk8Q8R3L8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk8Q8R3L8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk8Q8R3L8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk8Q8R3L8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk8Q8R3L8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk8Q8R3L8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk8Q8R3L8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk8Q8R3L8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cdk8Q8R3L8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk8Q8R3L8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk8Q8R3L8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms