Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms